Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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