Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
IFT88Q13099 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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IFT88Q13099 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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IFT88Q13099 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFT88Q13099 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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