Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFX1Q12986 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms