Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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