Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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