Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RBBP4Q09028 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RBBP4Q09028 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms