Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP2P78314 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP2P78314 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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