Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TTPAP49638 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TTPAP49638 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TTPAP49638 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TTPAP49638 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TTPAP49638 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms