Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPREP23469 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPREP23469 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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