Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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PTPRDP23468 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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