Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
TMX3Q96JJ7 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TMX3Q96JJ7 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TMX3Q96JJ7 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TMX3Q96JJ7 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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