Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPROQ16827 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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