Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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E2F4Q16254 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F4Q16254 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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