Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZIC1Q15915 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms