Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SCN9AQ15858 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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