Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMC1AQ14683 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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