Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms