Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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ATP1A4Q13733 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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