Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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