Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEUROD1Q13562 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms