Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TCIRG1Q13488 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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