Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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