Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NME3Q13232 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NME3Q13232 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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