Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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ERCC8Q13216 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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