Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CHAF1AQ13111 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms