Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTP4A2Q12974 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTP4A2Q12974 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTP4A2Q12974 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTP4A2Q12974 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTP4A2Q12974 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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