Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF1Q12946 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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