Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPEQ02224 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms