Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PTPRMP28827 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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