Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HOXD10P28358 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HOXD10P28358 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD10P28358 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD10P28358 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms