Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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