Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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