Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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