Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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