Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP35Q9P2H5 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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USP35Q9P2H5 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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USP35Q9P2H5 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP35Q9P2H5 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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