Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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