Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIM63Q969Q1 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms