Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
C15orf40Q8WUR7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms