Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms