Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms