Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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