Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTF1Q16619 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms