Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ECM1Q16610 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ECM1Q16610 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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