Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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