Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYCP1Q15431 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms