Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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