Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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COL19A1Q14993 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL19A1Q14993 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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