Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms