Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CHD4Q14839 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHD4Q14839 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CHD4Q14839 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CHD4Q14839 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CHD4Q14839 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHD4Q14839 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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