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| CHD4 | Q14839 | HSFY2-202 | ENST00000344884 | 1038 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CHD4 | Q14839 | MAGI2-AS2-201 | ENST00000411616 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AL353148.1-204 | ENST00000426752 | 477 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC093579.1-201 | ENST00000439455 | 352 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CHD4 | Q14839 | SUB1-206 | ENST00000506237 | 908 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC004853.1-201 | ENST00000604902 | 698 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC103710.4-201 | ENST00000609301 | 899 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL355810.1-201 | ENST00000614629 | 552 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC120349.3-201 | ENST00000624377 | 529 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| CHD4 | Q14839 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | ST7-AS2-206 | ENST00000456577 | 1351 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTCO1P17-201 | ENST00000411522 | 491 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC087190.1-201 | ENST00000484462 | 480 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC097521.1-201 | ENST00000505488 | 567 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC004062.1-201 | ENST00000509926 | 645 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | LTV1P1-201 | ENST00000510683 | 1237 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTCYBP41-201 | ENST00000528913 | 1123 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |