Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SCARB2Q14108 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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